Change search
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Försök att isolera genen för kloritdismutas från Ideonella dechloratans
2000 (Swedish)Independent thesis Basic level (professional degree)Student thesis
Abstract [sv]

Klorat, bildat som en biprodukt vid massaframställning, kan elimineras genom reduktion. Ideonella dechloratans är en bakterie som har förmåga att anaerobt reducera klorat till klorid. Reaktionen sker i två steg, där det andra steget utförs av enzymet kloritdismutas, som omvandlar klorit till klorid och syre. Jag har med två olika metoder försökt finna genen för kloritdismutas i Ideonella dechloratans. I den första metoden har E.coli, innehållande Ideonella dechloratans genbibliotek, odlats i närvaro av klorat, varefter klorattåliga kolonier identifierats och tolkats som eventuellt innehållande den eftersökta genen. I den andra metoden har en sekvens från Ideonella dechloratans genom, som hybridiserat i Southern blotting, sekvenserats. En tolkning av sekvensen har dock visat att den inte innehöll genen för kloritdismutas utan istället en del av genen för malatsyntas. Att jag funnit en del av genen för malatsyntas i den undersökta bakterien har givit viss information om organismens kodonanvändning. Det här har medfört, att arbetet att finna genen för kloritdismutas i framtiden kan utföras med en prob, vilken degenererats till mindre del än de prober som hittills använts.

Abstract [en]

Chlorate, formed as a waste product at pulp manufacture, can be eliminated by reduction. Ideonella dechloratans is a bacterium with the ability to anaerobically reduce chlorate to chloride. The reaction takes place in two steps, where the second step is performed by the enzyme chlorite dismutase, which converts chlorite to chloride and oxygen. Two different methods have been used to search for the gene for chlorite dismutase in Ideonella dechloratans. In the first method E.coli, containing the genomic library of Ideonella dechloratans, was grown in presence of chlorate, whereupon colonies tolerant to chlorate were identified and interpreted as possibly containing the searched for gene. In the second method, a sequence from the genome of Ideonella dechloratans, which hybridised in Southern blotting, was sequenced. The sequence did not contain the gene for chlorite dismutase but a section of the gene for malate synthase. The fact that I have found a section of the gene for malate synthase in the bacterium investigated has given some information about the codon usage in this organism. This means, that future work to find the gene for chlorite dismutase can be done using a probe, less degenerate than those used up to now.

Place, publisher, year, edition, pages
2000. , 51 p.
Identifiers
URN: urn:nbn:se:kau:diva-52632Local ID: KEM-9OAI: oai:DiVA.org:kau-52632DiVA: diva2:1101159
Subject / course
Chemistry
Available from: 2017-05-29 Created: 2017-05-29

Open Access in DiVA

No full text

Search outside of DiVA

GoogleGoogle Scholar

CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf